Precalentar el horno a 200°C.
En una sartén, calentar el aceite de oliva a fuego medio-alto. Agregar la cebolla y el ajo y cocinar hasta que estén suaves y dorados. Agregar el tomate, los chiles jalapeños, las aceitunas, las alcaparras y las hojas de laurel. Cocinar durante 10 minutos, o hasta que la salsa se haya espesado un poco. Añadir el jugo de limón y el tomillo fresco, y sazonar con sal y pimienta negra al gusto.
En un refractario para horno, colocar los filetes de pescado. Cubrirlos con la salsa y hornear durante 25-30 minutos, o hasta que el pescado esté cocido y se desmenuce fácilmente con un tenedor. Servir caliente, acompañado de arroz blanco y tortillas de maíz recién hechas.